畜牧与动物医学论文_鸡GATA基因家族鉴定及生物
文章摘要:为了解鸡GATA（ChGATA）家族基因特性，利用生物信息学方法对ChGATA基因家族成员进行鉴定，分析其理化性质、染色体定位、基因结构、保守基序、进化关系、蛋白质结构及蛋白质互作关系。结果表明，共鉴定出6个ChGATA基因，不均匀地分布在5条染色体上。根据蛋白质保守结构域命名为ChGATA2—ChGATA6和ChTRPS1。理化性质分析结果显示，ChGATA均为不稳定的亲水蛋白质，且除ChTRPS1外均为碱性蛋白质。二级结构预测分析结果显示，ChGATA主要由不规则卷曲组成。保守结构域分析结果显示，ChGATA均包含ZnF＿GATA结构域。系统进化分析结果显示，ChGATA基因家族可分为3个亚群，且同一亚群的基因结构相似、蛋白质三级结构相似、相互作用蛋白质较一致、亲缘关系较近。
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